Bob, Kevin en Charles zijn blij dat er eindelijk een einde is gekomen aan de rusteloze zoektocht van Hannah. Na de dood van commissaris Vermaelen is het team benieuwd wie hun nieuwe chef zal worden. Veel tijd om na te denken krijgen ze echter niet, want een jong meisje heeft zich verhangen in een internaat. Hannah ontdekt al snel dat het slachtoffer verkracht en verdoofd werd. Het zedenteam wil de zaak tot op de bodem uitspitten en onderzoekt de rol van zuster Adelheid, het oerconservatieve hoofd van het meisjesinternaat.
Margot, een drankverslaafde vrouw die voor een sekslijn werkt, zoekt hulp bij Hannah nadat ze tijdens haar laatste gesprek met de dood werd bedreigd. De sectie zeden besluit om de lucratieve sekshandel, die gerund wordt door de duistere John Vervoort, binnenstebuiten te keren. Wanneer Margo in een ondergrondse parking wordt verkracht, krijgt Hannah het aan de stok met haar overste, hoofdcommissaris Greet Adriaens. Ondertussen wordt ook Nathalie, de dochter van Margot, bedreigd. Terwijl Bob dag en nacht de wacht houdt bij de bevallige Nathalie, lijken alle sporen in de richting van John Vervoort te wijzen.
Kevin en Hannah worden opgeroepen als blijkt dat Lisa, een patiënte van de psychiatrische instelling Levensadem, in haar slaap werd verkracht. Lisa's oom Serge eist dat Hannah en haar team de instelling laten sluiten en verdenkt bovendien de directeur van het misdrijf. Hannah is ervan overtuigd dat de verkrachter binnen de instelling moet worden gezocht en vraagt de medische rapporten van alle patiënten op. Terwijl Bob en Charles een analyse maken van de bewakingsbeelden, ontdekt Hannah dat Lisa een tweede keer werd verkracht.
Het ontzielde lichaam van een getrouwde 35-jarige moeder wordt gevonden in een hotel. Tijdens het onderzoek wordt al snel duidelijk dat het slachtoffer een nymfomane was, die er een dubbelleven op nahield. De vraag is welke onenightstand haar uiteindelijk fataal is geworden.
Een bekende schrijver wordt aangerand in een sekscinema. Hij had er een afspraakje met Roos, een jonge studente die bijklust als prostituee. Al snel wordt duidelijk dat er wel meer studentes actief zijn in de prostitutie. Voldoende reden voor Hannah en haar team om undercover te gaan in club Sin City, een vrijhaven voor iedereen die het daglicht schuwt en voor meisjes die er hun klanten oppikken. Wanneer Hannah en haar team ontdekken dat de eigenaar van zowel de sekscinema als van Sin City de oom van Roos is, neemt de zaak een persoonlijke wending.
Er dreigt een rel te ontstaan nadat een politieman een ogenschijnlijk ongewapende, donkere man heeft neergeschoten. Mac en het team voelen de druk om deze zaak zo snel mogelijk op te lossen, waardoor de rust in de gemeenschap kan terugkeren.
Tijdens de viering van Valentijnsdag vinden er drie moorden plaats. De rechercheurs storten zich op de verschillende zaken, maar zijn daarnaast ook erg druk met hun persoonlijke invulling van deze feestdag.
Mac en het team proberen samen met hun collega D.B. Russell uit Las Vegas om de kidnappers van Christine te slim af te zijn voordat het te laat is om haar leven te redden.
Een jonge medewerker van een pizzeria wordt tijdens een bezorgronde overvallen en vindt daarbij de dood. Het CSI-team onderzoekt waar de daders precies naar op zoek waren.
Een zakkenroller komt om het leven na een dodelijke val van een balkon bovenop een geparkeerde auto. Het CSI-team ontdekt dat er opzet in het spel is en gaat op zoek naar de dader. Jo krijgt verontrustend nieuws met betrekking tot haar overleden zus.
Een zeer geliefde New Yorkse politieagent komt om het leven tijdens een overval. Het CSI-team gebruikt de allerbeste verhoortechnieken om verdachten in deze zaak te breken, om zo de waarheid te achterhalen.
Het CSI-team krijgt te maken met een raadselachtige zaak, wanneer twee slachtoffers van verschillende misdrijven zijn omgebracht met hetzelfde ongebruikelijke wapen.
De eigenaar van een illegale kroeg wordt vermoord gevonden en er blijkt 10.000 dollar te zijn ontvreemd. Het team duikt in deze zaak, terwijl Adam zijn dag op een onverwachte manier doorbrengt.
Het team duikt in de veeleisende wereld van kostscholen na de moord op een student. Lindsay brengt een bezoek aan haar vader in Montana en probeert daar een aantal gebeurtenissen uit haar verleden een plek te geven.
Mac stort zich op een zaak waarbij de hoofdverdachte van een ontvoering vermoord wordt gevonden op de herdenkingsdag van de ontvoerde jongen. Flacks vrije dag wordt opgeslokt door slepende familieperikelen.
Een moord onder de Brooklyn Bridge zorgt voor aanwijzingen betreffende de vermissing van een tienermeisje. Mac en Jo reizen af naar San Francisco om haar te zoeken, ook al weten ze niet zeker of ze überhaupt nog in leven is.
Het CSI-team zet alles op alles om seriebrandstichter Leonard Brooks een halt toe te roepen nu hij een wraakcampagne is begonnen tegen personen uit zijn duistere verleden.
Het team doet onderzoek naar een brand waarbij een bevriende brandweercommandant van Mac om het leven is gekomen. De hulp van een veroordeelde brandstichter wordt ingeroepen om de oorzaak van de dodelijke vuurzee te achterhalen.
Een van de meest gevreesde vijanden van het CSI-team wordt vermoord gevonden. Aan Horatio de moeilijke taak om te bepalen wie van zijn teamleden een verdachte is.
Horatio ontdekt een groot corruptieschandaal waarbij hij tegenover een oude vijand komt te staan. Ondertussen neemt Calleigh een beslissing die haar leven zal veranderen.
Een seriemoordenaar slaat weer toe. Tijdens het onderzoek komt Horatio uit bij de familie van de vermeende moordenaar. Of hij hulp van de familie kan verwachten, is nog maar de vraag.
Een accountant wordt dood gevonden nadat hij op zee is overvaren. Het blijkt dat de man veel illegale praktijken heeft blootgelegd, wat hem veel vijanden heeft opgeleverd.
De dood van een parachutist leidt het CSI-team naar de kinderen van de vermoorde man. De man blijkt meer dan honderd kinderen te hebben en ze zijn allemaal verdacht.
De moeder van een kind dat deelneemt aan een schoonheidswedstrijd wordt vermoord. Het team duikt in deze zaak en legt de duistere kant van de wereld van schoonheidswedstrijden voor kinderen bloot.
Wanneer Horatio weer een lijk ontdekt waarbij de ogen ontbreken, wijst alles naar zijn aartsvijand de `Miami Taunter´. Het kan echter ook het werk van een copycat zijn, die met zijn daden een eerbetoon wil brengen.
Het CSI-team is de jacht begonnen op een sadistische moordenaar, die vrouwen berooft van hun ogen. Hierdoor staat Horatio een nieuwe uitdaging te wachten.
Een tornado raast over een plaats delict, waardoor het bewijsmateriaal beschadigd raakt en daarnaast ook de levens van Ryan en Walter in gevaar worden gebracht.
Het leven van Horatio en Natalia hangt aan een zijden draad. Voor het team is het een race tegen de klok om de ontsnapte moordenaar Jack Toller tegen te houden, voordat hij weer toeslaat.
Hannah besluit om Iris Nys op te zoeken en haar link met Erwin Struelens met haar te bespreken. De vrouw is echter minder behulpzaam dan Hannah had verwacht. Intussen krijgt de afdeling Zeden te maken met een klacht van ongewenste intimiteiten op het werk. Lotte beweert dat haar zus Eva seksueel wordt geà ntimideerd op de bouwwerf waar ze werkt. Eva ontkent echter plots alle aanklachten, waardoor Hannah denkt dat ze iemand probeert te beschermen. Kevin, Charles en Bob ondervragen de collega´s van Eva, maar dat loopt niet zo makkelijk als ze hadden gehoopt. Hannah en Koen beleven romantische momenten.
Het team van Hannah Maes krijgt een anoniem filmpje toegestuurd waarop de verkrachting te zien is van Lily Laets, de zwangere vriendin van de eigenaar van een bekende seksclub in Gent. Hannah vermoedt dat er meer aan de hand is en laat Bob, Charles en Kevin de seksclub observeren. Hannah blijft intussen hoog spel spelen met Erwin Struelens. Hij laat haar in niet mis te verstane termen horen dat ze maar beter het verleden voor altijd kan laten rusten.
Drie mannen worden na negentien jaar gevangenschap vrijgelaten. Ze kunnen echter niet lang genieten van hun vrijheid, want een voor een worden ze neergestoken. Het CSI-team onderzoekt de link met de moord van bijna twintig jaar geleden, in de hoop aanwijzingen te vinden die naar dader kunnen leiden.
De ware identiteit van rechercheur Lovato wordt onbedoeld onthuld tijdens een undercoveroperatie bij een Latijns-Amerikaanse bende. Het CSI-team duikt in deze zaak en probeert uit te vinden wat hiervan de oorzaak is geweest.